詳細介紹
Equi-phi29 DNA Polymerase試劑是phi29的改造體,并經多次純化分離而得。在保留了phi29 DNA聚合酶的鏈置換、連續合成特性(>70kb)的基礎上,提高了滾環擴增的反應溫度,該酶酶可以在42℃條件下持續的進行DNA合成(而phi29 DNA 聚合酶在此溫度下反應活性很低)。
這種高溫的反應特性,在以下幾個方面對實驗有明顯的提升:(1)在NGS測序中,其提升了高GC含量、回文結構等復雜模板的延伸能力,使得NGS的覆蓋度更均一,降低測序所需深度;(2)高溫的反應條件,提升了基因組DNA的WGA產物的合成量,并可以進行變溫擴增;(3)降低測序中Gap區域,提升單細胞測序的數據質量和完整度;(4)降低非特異性擴增產物;(5)提升MDA/RCA等實驗的擴增性能和特異性。
此外,Equi-phi29 DNA Polymerase仍然具有很強的3’-5’外切酶校讀功能,合成的DNA片段保真性高。該酶的外切酶活性較強,因此合成過程中引物需要3’端硫代修飾,以降低外切活性對引物的切割效應。
主要特征
鏈置換能力
連續合成能力
擴增的高保真性
應用
DNA恒溫滾環擴增
需強鏈置換和DNA連續合成的反應
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高保真快速復制
儲存
-20℃可保存3年。
Equi-phi29 DNA Polymerase試劑恒溫擴增使用策略及實例展示
應用實例1:在以A3824-03或 A3828-03,用 LP1002引物組進行的LAMP測試。Bst4.0 SYBR Green試劑可在標準定量PCR儀或恒溫熒光儀上進行反應。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應25min的檢測結果,可以看到檢測反應<20min(達平臺期)。
應用實例2: 用 LP1002引物組進行的LAMP測試。OG變色法為終點變色策略,在反應結束后,倒置反應管,溶解管蓋上染料后,陽性樣本呈現出醒目的綠色,陰性表現出橙色,區分明顯。且該方法不受樣本類型限制,雜質耐受性很好。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應20min后檢測結果。
應用實例3:A3825-01 紅黃變色反應(肉眼觀察)
以 體外轉錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結束反應起
始前,下圖為 65 度反應 30min 后。
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