詳細介紹
PBCV DNA連接酶試劑也稱為SplintR 連接酶或 Chorella 病毒 DNA 連接酶,它能夠高效催化相鄰的 DNA 核苷酸的連接,
這個連接過程需要一條互補的 RNA 在兩條 DNA 單鏈間起“夾板"或“橋梁"的固定作用。PBCV DNA連接酶的這種活性遠遠
優于傳統的T4 DNA連接酶,有助于miRNAs和mRNAs,包括SNPs在內的研究方法的創新。另外,在二代測序和分子診斷等
眾多領域中,PBCV DNA連接酶是富集目的基因的理想選擇。它具有穩定的生物活性,對 RNA 介導固定的 DNA 底物親和性強
(米氏常數 Km = 1 nM),能夠在復雜的混合物中檢測到亞納摩爾級的特定 RNA。因此,在 RNA 檢測技術中,PBCV DNA
連接酶不失為很好選擇用酶。組分
組分名稱數量
PBCV DNA Ligase(25 U/μl)50μl
10×PBCV Ligase Buffer250μl
活性定義
25°C反應30分鐘條件下,使1pmol的DNA:RNA雜交底物連接所需要的酶量定義為1Unit。
反應溫度及失活
該酶的最佳反應溫度為25度,可在16-37度之間優化,37度可明顯提高反應的特異性;該酶在65°C 加熱20min即可失活。
儲存
-20℃可保存3年。
使用注意事項
1. 該酶對一價陽離子非常敏感,如NaCl或KCl的濃度應低于50mM。
2. 該酶的反應溫度為16~37℃,隨著溫度的上升酶活性會提高,但此時腺苷化產物也隨之增加,最佳溫度為25 ℃。
3. 連接效率隨著夾板RNA長度的減少而降低,當長度小于等于10nt時,連接效率為零。
PBCV DNA連接酶試劑恒溫擴增使用策略及實例展示
應用實例1:在以A3824-03或 A3828-03,用 LP1002引物組進行的LAMP測試。Bst4.0 SYBR Green試劑可在標準定量PCR儀或恒溫熒光儀上進行反應。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應25min的檢測結果,可以看到檢測反應<20min(達平臺期)。
應用實例2: 用 LP1002引物組進行的LAMP測試。OG變色法為終點變色策略,在反應結束后,倒置反應管,溶解管蓋上染料后,陽性樣本呈現出醒目的綠色,陰性表現出橙色,區分明顯。且該方法不受樣本類型限制,雜質耐受性很好。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應20min后檢測結果。
應用實例3:A3825-01 紅黃變色反應(肉眼觀察)
以 體外轉錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結束反應起
始前,下圖為 65 度反應 30min 后。
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