詳細介紹
南極熱敏UDG試劑是來源于嗜冷海洋細菌經大腸桿菌表達純化的的重組蛋白,又稱南極熱敏UDG。該熱敏UDG酶能有效地水解單鏈或雙鏈 DNA 上的尿嘧,產生的缺嘧啶位點,在高溫或高 pH 下,極易水解斷裂。該熱敏UDG酶對RNA無活性,主要用于PCR擴增產物的防污染。大腸桿菌來源的尿嘧-DNA 糖基化酶較為耐熱,經95℃10min處理仍會殘留有少量的尿嘧-DNA 糖基化酶活性,導致含有dU堿基的PCR產物的降解。而來源于嗜冷海洋細菌的熱敏UDG在50℃ 5min即失活,在進行PCR擴增前,在PCR混合液中添加尿嘧-DNA 糖基化酶(熱敏性),25℃ 2min即可消除PCR產物的殘留污染,由于尿嘧-DNA 糖基化酶(熱敏性)在PCR循環的94℃變性一步便可被滅活,因此不會影響新的含dU的PCR產物。
應用
去除單鏈或雙鏈DNA中的尿嘧堿基
去除 PCR 殘存污染
活性定義
在標準反應體系下,37°C每分鐘催化60 pmol 尿嘧從含尿嘧的雙鏈DNA上釋放所需要的酶量為一個活性單位。
反應buffer
ThermoLabile Uracil DNA Glycosylase (UDG)與絕大多數的PCR 聚合酶反應緩沖液都是兼容的,但在高離子濃度(>100mM)下活性會受到抑制。
酶保存液
20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT, , 50% Glycerol, 0.1% (w/v) Triton X-100, pH 7.5。
儲存
-20℃可保存2年。
熱失活
50℃,5min。
南極熱敏UDG試劑恒溫擴增使用策略及實例展示
應用實例1:在以A3824-03或 A3828-03,用 LP1002引物組進行的LAMP測試。Bst4.0 SYBR Green試劑可在標準定量PCR儀或恒溫熒光儀上進行反應。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應25min的檢測結果,可以看到檢測反應<20min(達平臺期)。
應用實例2: 用 LP1002引物組進行的LAMP測試。OG變色法為終點變色策略,在反應結束后,倒置反應管,溶解管蓋上染料后,陽性樣本呈現出醒目的綠色,陰性表現出橙色,區分明顯。且該方法不受樣本類型限制,雜質耐受性很好。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應20min后檢測結果。
應用實例3:A3825-01 紅黃變色反應(肉眼觀察)
以 體外轉錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結束反應起
始前,下圖為 65 度反應 30min 后。
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