詳細介紹
RAPA3G Probe qPCR MasterMix試劑將熱啟動 RAPA3G
DNA 聚合酶、反應 Buffer、dNTP 染料等試劑預混在一起,
是一種 2×濃度的單組分預混試劑。該制品不含有 ROX 校正
染料,適用于各種熒光標記探針,并且適用于各種定量 PCR
機型。優化的反應緩沖液,使得該制品可用于單重及多重的
探針法定量 PCR。
制品中的 RAPA3G DNA 聚合酶為第三代 DNA 聚合酶,
其具有最高的雜質耐受性,其對乙醇、胍鹽、肝素、血清、
植物多糖多酚具有的耐受性,因此可用于粗樣品的直接
定量 PCR 檢測(Direct PCR)。該酶經化學法修飾,在 50℃
以下 100%無活性,只有 95 度條件下加熱 5min 后才能
恢復酶的活力。因此該系統可以有效抑制非特異性 PCR 擴
增,極大的提高了 PCR 擴增特異性。
由于 RAPA3G DNA 聚合酶對 dUTP 具有的識別能
力,該制品中的 dTTP 核酸堿基被 dUTP 所取代,因此
擴增產物均包含 dUTP,在配合熱敏 UDG(該酶在 95℃熱
變性 5min 后不可逆失活,不影響后續 PCR 反應)的條件下
能達到最佳的防污染能力。在 10e5 copies 污染物的測試條
件下,Ct 推遲 15 個以上(污染去除能力>99.997%)。
包裝
2×RAPA3G Probe MasterMix (with UDG)
A2262A 1 ml
A2262B 25 ml
儲存:-20℃可保存 2 年。短期使用可放置 2-8℃,保存 3 個
月。如出現白色沉淀溶解后使用,不影響反應性能。該試劑
經 30 次凍融后性能無下降,因此不使用時請置于-20℃避光
保存。
RAPA3G DNA 聚合酶對抑制物耐受性
SDS 0.01% Serum 2%
EtOH 5% Plasma Citrate 2%
Heparin 0.1IU/ml Gua SCN 0.25%
Hematin 30μM Trizol 0.5%操作方法
1、按照如下組分配制 20 μl PCR 反應體系:
終濃度
2×RAPA3G Probe MasterMix(with UDG) 10 μl 1×
Primer F1 (20 μM) 0.1-0.4 μl 0.1-0.4 μM
Primer R1 (20 μM) 0.1-0.4 μl 0.1-0.4 μM
Probe1 (20 μM) 0.1-0.4 μl 0.1-0.4 μM
其它引物和探針 X
DNA 模板 0.5~2 μl
ddH2O Up to 20 μl
2. 進行 Real-Time PCR 反應,通常采用兩步法,程序如下:
Stage 1 25℃ 2 min 去污染
Stage 2 95℃ 5 min 熱啟動
Stage 3
40 循環
95℃ 5 s 變性
60℃ 30 s 收集信號 退火/延伸
注意:退火延伸溫度可在 55-65℃調整
3. 在多數情況下,采用兩步法程序可獲得理想的擴增效果,
在無法達到預期理想效果的情況下,也可采用三步法 PCR
程序,程序如下:
Stage 1 25℃ 2 min 去污染
Stage 2 95℃ 5 min 熱啟動
Stage 3
40 循環
95℃ 5 s 變性
55℃ 10 s 退火
72℃ 30 s 收集信號 延伸
4. 反應結束后確認 Real-Time PCR 的擴增曲線和標準曲
線。R Gre
注意:消化污染步驟中的溫度設置可在 25-37℃之間均可,無顯著
差異,但高于 42℃以上的溫度會導致熱敏 UDG 消化能力急劇下降。
恒溫擴增使用策略及實例展示
應用實例1:A3825-01 紅黃變色反應(肉眼觀察)
以 體外轉錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結束反應起始前,下圖為 65 度反應 30min 后。
應用實例2:在以A3824-03或 A3828-03,用 LP1002引物組進行的LAMP測試。Bst4.0 SYBR Green試劑可在標準定量PCR儀或恒溫熒光儀上進行反應。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應25min的檢測結果,可以看到檢測反應<20min(達平臺期)。
應用實例3: 用 LP1002引物組進行的LAMP測試。OG變色法為終點變色策略,在反應結束后,倒置反應管,溶解管蓋上染料后,陽性樣本呈現出醒目的綠色,陰性表現出橙色,區分明顯。且該方法不受樣本類型限制,雜質耐受性很好。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應20min后檢測結果。
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