詳細介紹
Exonuclease III試劑來源于E.coli,具有3'-5'外切酶活性,它作用于雙鏈 DNA,從 3' OH 末端方向逐步切去單核苷酸;每次酶與底物
結合催化,只有幾個核苷酸被除掉,從而在 DNA 分子群內產生漸進缺失。該酶的最佳底物為平末端、5'突出末端雙鏈DNA分子
,但也可作用于雙鏈DNA的缺刻處,從3'降解DNA分子,釋放5'單核苷酸。對于3'突出末端,尤其是多于4nt的幾乎不切割,
亦不能切割硫代磷酰脂鍵。核酸外切酶 III 的活性部分依賴螺旋結構,并根據序列的不同而有差異(C>A=T>G)。另外,
核酸外切酶 III還具有脫嘌呤/嘧啶-核酸內切酶活性、RnaseH活性和3' 磷酸酶活性。
組分
名稱數量
Exonuclease III (100 U/μl)50 μl
10X Exonuclease III Buffer1 ml
應用
非定向巢式缺失
定點突變
鏈特異性探針的制備
制備用于雙脫氧測序的單鏈底模板
單位定義
50 μl 反應體系中,37℃ 條件下,30 分鐘 催化E.coli DNA 產生 1 nmol 酸可溶性產物所需要的 量定義為一個活性單位。
1X Exonuclease III Buffer
10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10 mM MgCl2,1 mM DTT。
熱失活
70°C 20min。
儲存
置于-20°C,可保存3年。
Exonuclease III試劑試劑恒溫擴增使用策略及實例展示
應用實例1:在以A3824-03或 A3828-03,用 LP1002引物組進行的LAMP測試。Bst4.0 SYBR Green試劑可在標準定量PCR儀或恒溫熒光儀上進行反應。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應25min的檢測結果,可以看到檢測反應<20min(達平臺期)。
應用實例2: 用 LP1002引物組進行的LAMP測試。OG變色法為終點變色策略,在反應結束后,倒置反應管,溶解管蓋上染料后,陽性樣本呈現出醒目的綠色,陰性表現出橙色,區分明顯。且該方法不受樣本類型限制,雜質耐受性很好。以體外轉錄RNA為模板,1-6分別為1、10、100、1000、10e4和10e6Copies,NTC為ddH2O為模板。下圖為65℃反應20min后檢測結果。
應用實例3:A3825-01 紅黃變色反應(肉眼觀察)
以 體外轉錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結束反應起
始前,下圖為 65 度反應 30min 后。
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